Vista に Cygwin をインストール [解決編] [cygwin]

/etc/postinstall/gnuplot.sh
あたりを何かしているところで止まる。
(他にも2つぐらい、止まってしまうシェルスクリプトがあったけれど名前忘れた)

セットアップをいったんキャンセルして、Explorer 上で問題のシェルスクリプトをどこかに移動。
で、もう一度セットアップを実行。

この繰り返しでOK。

移動したシェルスクリプトが気になるなら、インストール後に元の位置に戻して、
cygwin 上からパスを指定して実行してやる。